LAMP檢測(cè)技術(shù)與qPCR檢測(cè)技術(shù)的區(qū)別與不足

LAMP檢測(cè) 與 qPCR檢測(cè)的區(qū)別與不足

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發(fā)表時(shí)間:2023-08-10 10:54

前幾篇文章我們分享了核酸檢測(cè)方法中LAMP檢測(cè)技術(shù)qPCR檢測(cè)技術(shù),那二者有何區(qū)別呢?今天小編就詳細(xì)說(shuō)說(shuō)LAMP檢測(cè)與qPCR檢測(cè)有何區(qū)別和不足。

擴(kuò)增原理:

LAMP:等溫?cái)U(kuò)增技術(shù),且引物設(shè)計(jì)與擴(kuò)增動(dòng)力學(xué)都很復(fù)雜。

qPCR:在不同溫度下進(jìn)行的循環(huán)性核酸擴(kuò)增技術(shù),通過(guò)熒光信號(hào)監(jiān)測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物的積累,實(shí)現(xiàn)定量分析。

溫度條件:

LAMP:一個(gè)恒定的等溫環(huán)境(通常在60-65°C),對(duì)設(shè)備要求較低。

qPCR:qPCR需要多個(gè)溫度循環(huán),包括變性、退火和延伸階段,需要精確的溫控設(shè)備。

引物設(shè)計(jì):

LAMP:使用多個(gè)引物,包括外部引物、內(nèi)部引物和環(huán)引物。這些引物的設(shè)計(jì)相對(duì)復(fù)雜,要求特定的序列和結(jié)構(gòu)。

qPCR:使用少量的引物(通常一對(duì)引物),引物設(shè)計(jì)相對(duì)簡(jiǎn)單,需要特異性和合適的引物序列。

實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè):

LAMP:產(chǎn)物通常通過(guò)肉眼可見(jiàn)的方式來(lái)判斷,也可以使用熒光染料等進(jìn)行增強(qiáng)。

qPCR:利用熒光探針或SYBR Green等熒光信號(hào)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物的積累,可以定量分析。

LAMP與qPCR相比有哪些不足?

由于LAMP方法與qPCR方法各自的特點(diǎn),導(dǎo)致這兩種檢測(cè)手段分別有其不同的適用范圍。

  1. 產(chǎn)物結(jié)構(gòu)復(fù)雜:LAMP擴(kuò)增產(chǎn)物呈現(xiàn)出高度分支的簇環(huán)結(jié)構(gòu),這種結(jié)構(gòu)可能對(duì)產(chǎn)物的純化和后續(xù)分析造成一些挑戰(zhàn)

  2. 不適用于大片段擴(kuò)增:LAMP技術(shù)相對(duì)適用于短片段的核酸擴(kuò)增,不太適用于較長(zhǎng)片段的擴(kuò)增,這一點(diǎn)與傳統(tǒng)PCR方法不同。

  3. 定量困難:LAMP技術(shù)的產(chǎn)物數(shù)量與起始模板數(shù)量之間的線性關(guān)系可能較差,因此在定量方面存在一定的局限性。

  4. 部分產(chǎn)物難以區(qū)分:LAMP反應(yīng)產(chǎn)物包括多個(gè)簇環(huán)結(jié)構(gòu),其中有些結(jié)構(gòu)可能與非特異性產(chǎn)物難以區(qū)分,可能對(duì)結(jié)果解釋帶來(lái)困擾。

LAMP:適用于快速、初步的檢測(cè),如一些疾病的早期篩查,野外環(huán)境中的檢測(cè)等。

如:臨床中的一些疾病檢測(cè)試劑盒。

qPCR:在精確定量和定性檢測(cè)方面表現(xiàn)出色,廣泛用于病原體檢測(cè)、基因表達(dá)分析等。

如:支原體qPCR檢測(cè)試劑盒

德國(guó)MB支原體qPCR檢測(cè)試劑盒

①經(jīng)典法qPCR試劑盒遵循歐洲藥典流程要求

②高特異性,一次檢測(cè)即可涵蓋了所有可能感染細(xì)胞的支原體物種(涵蓋歐洲藥典規(guī)定的9種支原體),根據(jù)序列一致性,至少可以檢測(cè)到107種支原體物種。操作簡(jiǎn)單,易于觀察(使用MB的試劑盒,下表中列出的支原體物種均為陽(yáng)性,其他微生物或真核細(xì)胞均為陰性,無(wú)交叉反應(yīng))。


支原體qPCR檢測(cè)試劑盒


支原體qPCR檢測(cè)試劑盒檢測(cè)物種

③高靈敏度,MB公司的支原體qPCR檢測(cè)試劑盒經(jīng)典法最低檢測(cè)限可達(dá)到≤10CFU/ml。

支原體qPCR檢測(cè)試劑盒檢測(cè)物種

MB公司的支原體qPCR檢測(cè)試劑盒一步法最低檢測(cè)限≥50個(gè)基因組/反應(yīng)。

④MB公司有相應(yīng)配套的10CFU/100CFU的敏感度測(cè)試的標(biāo)準(zhǔn)品,便于方法學(xué)驗(yàn)證。

⑤MB公司有相應(yīng)配套的支原體基因組DNA和細(xì)菌基因組DNA,便于特異性驗(yàn)證。

⑥MB公司有相應(yīng)配套的支原體絕對(duì)定量標(biāo)準(zhǔn)品,便于最后定量檢測(cè)。

支原體qPCR檢測(cè)試劑盒特點(diǎn)

1.內(nèi)控對(duì)照為獨(dú)立包裝,遵循歐洲藥典和日本藥典操作流程。

2.高特異性,一次檢測(cè)即可涵蓋所有常見(jiàn)易感染細(xì)胞的支原體物種(包括歐洲藥典規(guī)定的9種支原體)。與細(xì)菌和真核DNA無(wú)交叉反應(yīng)。

3.高靈敏度,最低檢測(cè)限可達(dá)到≤10CFU/ml。

4.相應(yīng)配套的支原體基因組DNA和細(xì)菌基因組DNA,便于特異性驗(yàn)證。

5.有相應(yīng)配套的支原體絕對(duì)定量標(biāo)準(zhǔn)品,便于最后定量檢測(cè)。

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