RNA 成熟對(duì)器官發(fā)育的作用的大規(guī)模研究

　　來(lái)自俄羅斯和德國(guó)的研究人員創(chuàng)建了一個(gè)基因組圖譜，包含了 6 種哺乳動(dòng)物和雞的 7 個(gè)器官的發(fā)育選擇性剪接變化。

　　這項(xiàng)研究發(fā)表在《Nature Genetics》雜志上。

　　隨著編碼 RNA 的蛋白質(zhì)在真核生物中成熟，它會(huì)被剪接，一些部分被剪掉，剩下的部分被縫合在一起。選擇性剪接意味著相同的 RNA 片段可以從成熟的 RNA 中剪掉，也可以保留在成熟的 RNA 中。在這種情況下，一個(gè)基因可以編碼多個(gè) RNA，因此也可以編碼多個(gè)蛋白質(zhì)。

　　雖然選擇性剪接對(duì)許多組織的發(fā)育和正常功能是必不可少的，其各種紊亂可能導(dǎo)致健康問(wèn)題，但其功能和在全基因組水平上的調(diào)控仍然非常缺乏了解。對(duì)于不同物種中選擇性剪接的比較研究大多是在成年生物體上進(jìn)行的，但科學(xué)家認(rèn)為選擇性剪接在生物體的發(fā)育中起著非常重要的作用。

　　Philipp Khaitovich 教授和 Skoltech 神經(jīng)生物學(xué)和大腦修復(fù)中心 (CNBR) 的研究科學(xué)家 Pavel Mazin 以及來(lái)自德國(guó)海德堡大學(xué)的同事們決定填補(bǔ)這一空白。

　　他們利用 RNA 測(cè)序技術(shù)為 6 種哺乳動(dòng)物和 1 種鳥(niǎo)類(lèi)的 7 個(gè)不同器官 (從器官發(fā)生到青春期的不同發(fā)育階段) 創(chuàng)建了一個(gè)可供選擇的剪接圖譜。該團(tuán)隊(duì)證明了選擇性剪接在形成器官 (如大腦、心臟和睪丸) 方面的基本重要性，而對(duì)于肝臟、腎臟和卵巢來(lái)說(shuō)，選擇性剪接顯示出的變化要弱得多，此外，結(jié)果發(fā)現(xiàn)所有被研究的物種都非常相似，并且主要在發(fā)育后期表達(dá)的基因中被檢測(cè)到，同時(shí)在幾個(gè)組織中也被檢測(cè)到。

　　這表明選擇性剪接主要用于創(chuàng)建在各種組織中起作用的組織特異性蛋白異構(gòu)體。

　　“由于較高的生物和實(shí)驗(yàn)噪音，替代剪接很難處理。這個(gè)項(xiàng)目的另一個(gè)挑戰(zhàn)是龐大的數(shù)據(jù)量: 我們必須處理大約 2000 個(gè)樣本。然而，更令人興奮的是看到從這種混亂中出現(xiàn)的模式和新的見(jiàn)解，” 主要作者 Pavel Mazin 說(shuō)。