單細胞RNA-seq揭示活化蛋白C對阿爾茨海默病的轉錄組調節

一篇新的研究論文發表在Aging (MEDLINE/PubMed列出的“Aging (Albany NY)”和Web of Science列出的“Aging- us”)第16卷第4期，題為“單細胞RNA-seq揭示了活化蛋白c對阿爾茨海默病的轉錄組調節”。

單細胞RNA測序揭示了阿爾茨海默病(AD)模型5xFAD (5x家族性AD突變)與野生型(WT)小鼠細胞群的變化。在這項新的研究中，來自南佛羅里達大學、密西西比大學醫學中心和G.V. (Sonny) Montgomery VA醫學中心的研究人員Mohammad Kasim Fatmi、Wang Hao、Lily Slotabec、Changhong Wen、Blaise Seale、Bi Zhao和Ji Li使用單細胞RNA測序和生物信息學分析分析了APC [Activated Protein C]治療對AD轉基因小鼠的影響。

“在我們的研究中，我們使用了含有五種主要淀粉樣蛋白病理表達的轉基因小鼠，這些淀粉樣蛋白病理允許AD和Aβ沉積的快速進展，被稱為5xFAD小鼠。”

返回的測序數據通過10x Genomics CellRanger平臺進行比對，形成相應的矩陣進行生物信息學分析。與WT相比，5xFAD的神經膠質細胞發生了改變，尤其是小膠質細胞的增殖在5xFAD中明顯增加。5xFAD與WT的膠質細胞差異表達檢測揭示了基因調控。在全球范圍內，與AD進展相關的關鍵基因如Apoe、Ctsb、Trem2和Tyrobp上調。

利用這些差異表達數據，我們完成了氧化石墨烯項富集，以觀察AD進展可能影響的生物學過程。利用抗炎和細胞保護重組活化蛋白C (APC)，研究人員發現，除了恢復神經系統過程外，APC治療還下調了炎癥過程。此外，動物研究表明，重組APC可顯著減輕5xFAD小鼠的Aβ負荷，改善其認知功能。

“在5xFAD中，高表達的AD生物標志物的下調可以為APC治療對AD有益的機制提供見解。”

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