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PCR Clean?祛除RNA的效果檢測

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發表時間:2024-12-04 16:30

德國Minerva Biolabs公司提供的PCR Clean?是針對實驗室常用的核酸污染祛除試劑,在常見的儀器、物品的污染祛除效果進行了檢測,并對其結果進行了詳細的闡釋。

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使用德國MB公司的ExtractNow?RNA提取試劑盒從人細胞中提取RNA。測量RNA濃度,并在plexglass?表面的6個不同點上各移液5μg(11μl)。

RNA完全風干,然后分別使用含有PCR Clean?、稀釋的洗潔精、70%乙醇、異丙醇、水或干紙巾的紙巾,通過擦拭污漬,將RNA移液。

用濕潤的棉簽擦拭同一區域收集樣本。

攜帶所收集的RNA樣本的拭子轉移到400μl裂解緩沖液中,使用ExtractNow?RNA提取試劑盒提取RNA。作為陽性對照,將人細胞中提取的5μg RNA直接轉移到400μl裂解緩沖液中,并以與其余樣品相同的方式處理。對包括陽性對照在內的所有RNA樣本進行逆轉錄,然后對合成的cDNA樣本進行qPCR。


結果顯示,與其他清洗劑和陽性對照相比,PCR Clean?從plexglass?表面祛除RNA后,RNA的損耗更大(表3)。這也可以在圖3中顯示,其中cDNA擴增的ct值,由RNA通過逆轉錄合成,與其他清洗劑祛除RNA后的ct值和陽性對照相比,PCR Clean?祛除RNA后的ct值更高,表明RNA量的減少幅度更大。


表3.使用PCR Clean?從plexglass?表面祛除RNA后,通過逆轉錄從RNA合成cDNA的qPCR擴增測量ct值,并與不同清洗劑進行比較。


圖3所示。用不同的清洗劑從plexglass?中祛除RNA后,通過逆轉錄由RNA合成的cDNA的qPCR擴增曲線(詳情見上圖)。



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