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熒光定量PCR原理和操作步驟

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發表時間:2025-01-10 16:34

熒光定量PCRQuantitative Real-time PCRqPCR)是一種在PCR擴增反應體系中加入熒光基團,對擴增反應中每一個循環產物熒光信號的實時檢測,最后通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。以下是熒光定量PCR的原理和步驟的詳細解釋:

一、熒光定量PCR原理

熒光定量PCR的基本原理是利用DNA聚合酶在PCR過程中合成新DNA鏈的特性,結合一種熒光標記的探針或染料,通過實時監測熒光信號的增加來測量PCR反應的進行程度,從而實現對靶DNA的定量分析。

PCR擴增時,加入一對引物的同時加入一個特異性的熒光探針(如TaqMan熒光探針),該探針為一寡核苷酸,兩端分別標記一個報告熒光基團和一個淬滅熒光基團。開始時,探針完整地結合在DNA任意一條單鏈上,報告基團發射的熒光信號被淬滅基團吸收,檢測不到熒光信號。PCR擴增時,Taq酶(具有5'-3'外切酶活性)將探針酶切降解,使報告熒光基團和淬滅熒光基團分離,從而熒光監測系統可接收到熒光信號,即每擴增一條DNA鏈,就有一個熒光分子形成,實現了熒光信號的累積與PCR產物形成完全同步。

另外,熒光定量PCR所使用的熒光物質也可分為熒光染料(如SYBR熒光染料)和熒光探針兩類。在PCR反應體系中加入過量SYBR熒光染料,SYBR熒光染料非特異性地摻入DNA雙鏈后,發射熒光信號,而不摻入鏈中的SYBR染料分子不會發射任何熒光信號,從而保證熒光信號的增加與PCR產物的增加完全同步。SYBR僅與雙鏈DNA進行結合,因此可以通過溶解曲線確定PCR反應是否特異。

二、熒光定量PCR步驟

熒光定量PCR的實驗步驟通常包括反轉錄(如檢測RNA樣品時)、擴增和檢測三個主要階段。以下是具體步驟:

反轉錄(如適用):對于RNA樣品,首先需要使用反轉錄酶將RNA反轉錄成cDNA,以便后續進行PCR擴增。

擴增:在PCR反應管中加入適量的cDNA模板、引物、dNTPs(脫氧核糖核苷三磷酸)、緩沖液和Taq DNA聚合酶等反應成分。然后,在PCR儀上進行擴增反應。擴增過程通常包括變性、退火和延伸三個步驟,通過控制溫度和時間來實現DNA的擴增。

檢測:在PCR擴增過程中,實時檢測熒光信號的強度。隨著產物的積累,熒光信號的強度等比加強。每經過一次循環,收集一次熒光信號,即可得到一個熒光擴增曲線。根據熒光強度的變化即可監測產物量的變化,從而實現對靶DNA的定量分析。

需要注意的是,熒光定量PCR的實驗步驟可能因實驗目的和所用試劑的不同而有所差異。因此,在具體實驗時,應參考試劑說明書和實驗指南進行操作。

綜上所述,熒光定量PCR是一種高靈敏度、高特異性的定量分析方法,在生物醫學研究、疾病診斷、病原體檢測等領域具有廣泛的應用價值。

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