新研究,解析結(jié)核分枝桿菌核糖核酸酶RNaseJ的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)及功能機(jī)制

解析結(jié)核分枝桿菌核糖核酸酶RNaseJ的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)及功能機(jī)制

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發(fā)表時(shí)間:2023-11-30 16:57

  2023420日,國(guó)際學(xué)術(shù)期刊《自然-通訊》(Nature Communications)在線發(fā)表了我室李繼喜教授和張雪蓮副教授團(tuán)隊(duì),及趙國(guó)屏院士團(tuán)隊(duì)的合作研究成果Structural insights into RNase J that plays an essential role in Mycobacterium tuberculosis RNA metabolism”。

  由結(jié)核分枝桿菌(Mtb)引起的結(jié)核?。?/span>TB)是全球最致命的傳染病,數(shù)千年來(lái)一直對(duì)人類(lèi)健康構(gòu)成嚴(yán)重威脅。Mtb每年在全世界造成約1000萬(wàn)新發(fā)結(jié)核病例和約200萬(wàn)例死亡。耐藥性Mtb的日益流行進(jìn)一步加劇了對(duì)新型抗分枝桿菌藥物的需求。RNA加工和降解是細(xì)菌RNA穩(wěn)態(tài)維持所必需,也是新型抗菌藥物發(fā)現(xiàn)的潛在靶點(diǎn)。核糖核酸酶RNases)負(fù)責(zé)RNA代謝。細(xì)菌通過(guò)這一過(guò)程調(diào)節(jié)特定基因的表達(dá),以快速適應(yīng)生長(zhǎng)環(huán)境的變化。不同物種間mRNA降解復(fù)合物(degradosome)具有顯著差異,其中RNase JMtb降解復(fù)合物的重要組成部分,在調(diào)節(jié)細(xì)菌生長(zhǎng)和生存中起著至關(guān)重要的作用。但目前尚無(wú)結(jié)核分枝桿菌來(lái)源RNase J結(jié)構(gòu)信息報(bào)道,相關(guān)酶活機(jī)制也不清楚。

  研究團(tuán)隊(duì)**解析了結(jié)核分枝桿菌核酸酶RNase J的處于apo狀態(tài)及其與7-nt RNA結(jié)合的復(fù)合物三維結(jié)構(gòu)。發(fā)現(xiàn)Mtb-RNase J使用鋅離子進(jìn)行雙金屬離子催化,形成具有Asp81,Asp85His86,His148,His170His397殘基的活性口袋。金屬離子Mn2+通過(guò)增加Mtb-RNase J對(duì)RNA底物的親和力,顯著增強(qiáng)其核酸酶活性。在恥垢分枝桿菌中敲除RNase J會(huì)極大改變菌落形態(tài)、生長(zhǎng)速率及RNA代謝途徑相關(guān)基因的表達(dá)水平;RNA-seq分析及進(jìn)一步的回補(bǔ)實(shí)驗(yàn)證實(shí)RNase J對(duì)于分枝桿菌的RNA代謝至關(guān)重要。相關(guān)工作為抗結(jié)核藥物的研發(fā)提供了新的視角。

   李繼喜課題組長(zhǎng)期從事病原體感染-宿主免疫應(yīng)答研究工作。近期已經(jīng)成功解析了結(jié)核分枝桿菌核糖體延伸因子EF-Tu/EF-Ts復(fù)合物(Zhan et al. Commun Biol, 2022)以及Mtb潛伏感染關(guān)鍵分子MazGWang et al. Front Biol, 2023)的三維結(jié)構(gòu),篩選到多個(gè)調(diào)控Mtb生長(zhǎng)的抑制性小分子化合物。


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