一種前所未有的現(xiàn)象:這種酶單獨(dú)處理DNA和RNA,完成功能完全轉(zhuǎn)換!

這種酶單獨(dú)處理DNA和RNA,完成功能完全轉(zhuǎn)換!

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發(fā)表時間:2023-12-21 16:40

科學(xué)家們揭示了一種蛋白質(zhì)中前所未有的現(xiàn)象:這種酶單獨(dú)處理DNARNA,但當(dāng)它與另一種蛋白質(zhì)結(jié)合成為防御系統(tǒng)的一部分時,會與一種完全不同的化合物相互作用,幫助細(xì)菌自殺。

這一發(fā)現(xiàn)是在研究人員集中精力詳細(xì)研究這種防御機(jī)制如何在被噬菌體感染的細(xì)菌中發(fā)揮作用時得出的。噬菌體是一種在細(xì)菌細(xì)胞內(nèi)侵入并復(fù)制自身的病毒。除了詳細(xì)描述蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和結(jié)合位點(diǎn)外,實(shí)驗(yàn)還揭示了這種前所未有的酶功能轉(zhuǎn)換。

資深研究作者、俄亥俄州立大學(xué)醫(yī)學(xué)院生物化學(xué)和藥理學(xué)助理教授Tianmin Fu說:這是一個重大發(fā)現(xiàn),當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)形成復(fù)合物時,通常會增加或降低酶的活性,但我們從未見過功能上的完全轉(zhuǎn)換。這對酶學(xué)領(lǐng)域來說是全新的。

他說,從更廣泛的角度來看,更好地了解細(xì)菌是如何利用防御系統(tǒng)死亡的,而不是被噬菌體感染,可以轉(zhuǎn)化為說服癌細(xì)胞也規(guī)劃自己死亡的療法。

Fu:“如果我們能將這種類型的系統(tǒng)引入癌細(xì)胞,這可能開發(fā)出新一代的癌癥治療策略。

這項(xiàng)研究1213日發(fā)表在《分子細(xì)胞》雜志上。

當(dāng)被噬菌體感染時,細(xì)菌會選擇死亡,以防止噬菌體接管細(xì)菌群落。這項(xiàng)研究中檢測的復(fù)合體是SIR2HerA蛋白質(zhì)的組合,它與其他數(shù)百種細(xì)菌防御系統(tǒng)一起,在以前側(cè)重于基因組分析的研究中被發(fā)現(xiàn)。

在大腸桿菌模型中,F(xiàn)u和同事使用低溫電子顯微鏡來確定蛋白質(zhì)單獨(dú)以及它們作為超分子復(fù)合物組裝期間和之后的生化結(jié)構(gòu)。

這個系統(tǒng)已經(jīng)在許多不同的細(xì)菌中被發(fā)現(xiàn),盡管我們在大腸桿菌中研究了它,但我們認(rèn)為它在其他細(xì)菌中的作用非常相似。

分析表明,SIR2HerA相互具有親和力,表明SIR2的輪狀結(jié)構(gòu)在兩者形成由6個相同的分子亞基組成的復(fù)合物之前起著HerA分子簇組織者的作用。然而,究竟是什么觸發(fā)了它們之間的聯(lián)系仍然是個謎。

結(jié)果表明,一旦組裝,該復(fù)合物可以在細(xì)菌中存在而不會發(fā)生意外,這表明細(xì)菌以某種方式抑制了系統(tǒng)的防御活性,除非噬菌體進(jìn)入現(xiàn)場。當(dāng)噬菌體被引入時,細(xì)菌很快就死亡了——這是它們自己設(shè)計的,因?yàn)榉烙到y(tǒng)已經(jīng)被激活,耗盡了細(xì)菌生存所需的一種叫做NAD+的小分子。到目前為止,這種激活機(jī)制仍然未知。

實(shí)驗(yàn)證實(shí),SIR2會丟棄NAD+,這讓人大吃一驚。SIR2作為核酸酶的首要任務(wù)是消化核酸以維持正常的細(xì)胞功能。但是當(dāng)與HerA結(jié)合并作為防御系統(tǒng)的一部分被激活時,它的酶功能發(fā)生了變化——SIR2變成了一種完全不同類型的酶,稱為NADase,它產(chǎn)生水基反應(yīng)來釋放NAD+

我們現(xiàn)在想要解決這個巨大的、基本的生物學(xué)問題——復(fù)雜的組裝是如何將SIR2的活性從核酸酶轉(zhuǎn)換為NADase? 弄清楚這種機(jī)制對這個領(lǐng)域來說意義重大,這個系統(tǒng)非常有趣,因?yàn)樗谝粋€預(yù)組裝的復(fù)合體中有如此多不同的酶活性。

Fu還設(shè)想了一個未來的合成生物學(xué)工具箱,在這個工具箱中,細(xì)菌的小把戲被改編成殺死癌細(xì)胞的策略。他說:“我們開始向細(xì)菌學(xué)習(xí),希望我們可以將它們重新編程為癌癥診斷和治療的有力工具。

這項(xiàng)工作得到了美國國立衛(wèi)生研究院的支持。

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