引物與qPCR檢測(cè)有什么關(guān)系?

引物在qPCR有什么關(guān)系?

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發(fā)表時(shí)間:2024-03-11 14:29

引物與qPCR有什么關(guān)系?

引物在實(shí)時(shí)定量聚合酶鏈反應(yīng)(quantitative PCR,qPCR)中扮演著重要的角色。引物的設(shè)計(jì)質(zhì)量直接影響著實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性和可靠性。

本文將探討引物在 qPCR 檢測(cè)中的意義,并介紹如何設(shè)計(jì)和選擇可靠的引物。


引物的作用

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Minerva Biolabs

特異性檢測(cè):

引物的主要作用是在DNA的特定區(qū)域結(jié)合并擴(kuò)增目標(biāo)序列。良好設(shè)計(jì)的引物對(duì)于特異性至關(guān)重要,確保只擴(kuò)增目標(biāo)DNA,而不受其他非特定序列的影響。

靈敏度:

引物的選擇直接影響著 qPCR 檢測(cè)的靈敏度。優(yōu)秀的引物設(shè)計(jì)可以保證低濃度的目標(biāo)DNA也能被可靠地?cái)U(kuò)增和檢測(cè),從而提高實(shí)驗(yàn)的靈敏度。

準(zhǔn)確性:

正確選擇的引物可以減少假陽(yáng)性和假陰性結(jié)果的風(fēng)險(xiǎn),確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性。

效率:

引物的設(shè)計(jì)還會(huì)影響擴(kuò)增的效率,良好設(shè)計(jì)的引物能夠在合適的溫度下快速擴(kuò)增目標(biāo)序列,提高實(shí)驗(yàn)效率。


引物設(shè)計(jì)原則

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長(zhǎng)度

引物的長(zhǎng)度通常在18到25個(gè)核苷酸之間,過(guò)長(zhǎng)或過(guò)短的引物都可能影響擴(kuò)增效率和特異性。


GC含量

引物的GC含量應(yīng)在40%到60%之間,過(guò)高或過(guò)低的GC含量會(huì)影響引物的穩(wěn)定性和特異性。


特異性

引物設(shè)計(jì)時(shí)要確保與非靶標(biāo)DNA的亞基序列不匹配,通常通過(guò)使用生物信息學(xué)工具進(jìn)行引物特異性檢測(cè)。


避免二聚體和結(jié)構(gòu)性問(wèn)題

引物設(shè)計(jì)時(shí)需要避免引物之間和引物與模板DNA之間的二聚體形成,同時(shí)也要避免引物自身的結(jié)構(gòu)性問(wèn)題。


避免SNP影響如果目標(biāo)區(qū)域存在單核苷酸多態(tài)性(SNP),要確保引物與目標(biāo)DNA序列的匹配性不受SNP影響。


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引物的設(shè)計(jì)和選擇是 qPCR 實(shí)驗(yàn)中至關(guān)重要的一環(huán),直接關(guān)系到實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性。在進(jìn)支原體qPCR檢測(cè)過(guò)程中,引物的選擇也十分重要。德國(guó)MB支原體檢測(cè)試劑盒Venor?GeM qEP,預(yù)混液中包含引物,幫助支原體檢測(cè)項(xiàng)目完成方法學(xué)驗(yàn)證。

Venor?GeM qEP

Venor?GeM qEP利用定量、實(shí)時(shí)PCR (qPCR)快速(約3小時(shí))和可靠的篩選細(xì)胞培養(yǎng)上清支原體污染。該試劑盒可與多種類型的實(shí)時(shí)PCR循環(huán)器結(jié)合使用,能夠檢測(cè)熒光染料FAM?和HEX?。

產(chǎn)品特點(diǎn)

德國(guó)MB公司生產(chǎn)的支原體qPCR檢測(cè)試劑盒有以下優(yōu)點(diǎn):

①經(jīng)典法qPCR試劑盒遵循歐洲藥典流程要求

②高特異性,一次檢測(cè)即可涵蓋了所有可能感染細(xì)胞的支原體物種(涵蓋歐洲藥典規(guī)定的9種支原體),根據(jù)序列一致性,至少可以檢測(cè)到107種支原體物種。操作簡(jiǎn)單,易于觀察(使用MB的試劑盒,下表中列出的支原體物種均為陽(yáng)性,其他微生物或真核細(xì)胞均為陰性,無(wú)交叉反應(yīng))。

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高靈敏度,MB公司的支原體qPCR檢測(cè)試劑盒經(jīng)典法檢測(cè)限可達(dá)到≤10CFU/ml。

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MB公司的支原體qPCR檢測(cè)試劑盒一步法最低檢測(cè)限≥50個(gè)基因組/反應(yīng)。

④MB公司有相應(yīng)配套的10CFU/100CFU的敏感度測(cè)試的標(biāo)準(zhǔn)品,便于方法學(xué)驗(yàn)證。

⑤MB公司有相應(yīng)配套的支原體基因組DNA和細(xì)菌基因組DNA,便于特異性驗(yàn)證。

⑥MB公司有相應(yīng)配套的支原體絕對(duì)定量標(biāo)準(zhǔn)品,便于最后定量檢測(cè)。

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