支原體檢測常見問題答疑(二)——MB支原體檢測試劑盒支原體檢測常見問題答疑(二) 二維碼
發(fā)表時間:2023-01-03 14:39作者:締一生物 上篇文章是支原體檢測常見問題(一),小編解答了部分的支原體污染檢測問題,本期締一生物小編繼續(xù)結(jié)合德國MB公司支原體檢測試劑盒來跟大家分享支原體檢測問題答疑。 問:被動參比染料是選“none”吧? ![]() 答:對,沒有ROX,選none 問:大家好,想咨詢一下,咱們支原體DNA提取時所取的樣本量是依據(jù)什么定的呢,比如,我們有CAR-T細胞,病毒液等,如果CAR-T細胞按細胞數(shù)來的話取多少細胞數(shù)比較好,或者如果病毒液按體積的話多少體積更佳呢? 答:支原體 DNA 提取試劑盒可從最多含有 1X 106細胞/ml 的細胞上清中直接分離 DNA,病毒沒有要求。總體積最多 200μl。提取的樣本就是細胞上清,ATMPs(高級醫(yī)用藥品),細胞培養(yǎng)基等。病毒液應(yīng)該也是最初來自細胞上清吧。樣本量是根據(jù)支原體污染量得出的經(jīng)驗值,跟核酸純化柱上的DNA膜吸附能力有關(guān)。 問:病毒液就是類似細胞上清的。如果體積大于200ul的話我們可以濃縮,但是這個體積有沒有一個上限呢? 答:體積有上限,是200 to 1000 μl, 可以參看經(jīng)典法試劑盒的那個說明書里對樣本處理那一塊。這個樣本量同時還考慮了靈敏度,使檢測達到**的靈敏度。如果細胞數(shù)高于1X 106細胞/ml ,那必須要先調(diào)細胞數(shù)了。或者減少樣本體積,總細胞數(shù)不超,也行。 問:您好,我這邊要提取10cfu對照品的基因組,10cfu對照品的說明書寫著用1ml基質(zhì)重懸,基因提取試劑盒說一次上樣200μl進行提取,想問您一下,用200μl基質(zhì)重懸10cfu可以嗎,想一次提完。 答:還是建議用1ml的基質(zhì)重懸,因為靈敏度是以10CFU/ml為單位的。如果用200ul,濃度就高了。廠家建議10CFU標準品復(fù)溶了以后,要立即用完,不要再保存,擔心可能降解。 問:那1ml溶解的標準品,按提取試劑盒的要求,就得用多個管子一次提完對吧? 答:是的。 問:這個抽提試劑盒的收率有多少,是磁珠還是吸附柱?吸附柱的收率**能有,因為以前我們用其他品牌的抽提試劑盒,收率只有百分之六,這樣的話,就存在假陰性結(jié)果的可能。 答:是吸附柱的方法。提取試劑盒的COA里,用的是很少量的支原體10CFU/ml,提取DNA后都可以檢測到。廠家來信說,產(chǎn)率依賴于DNA的類型(如GC含量,是基因組還是質(zhì)粒)、操作者的技巧以及樣本基質(zhì)的情況。因為這些情況,操作者很難達到生產(chǎn)商所給的比率,從而形成各種討論,因此產(chǎn)率沒寫到說明書里。 問:要檢測支原體的培養(yǎng)基中有酚紅,是否還需要抽提? 答:只要是在25ulPCR體系中加入的樣本量≤2ul,酚紅就不會對qPCR構(gòu)成問題。更高濃度的酚紅會引起基線偏移,造成靈敏度降低。如果僅僅是篩查,則不需要抽提DNA。如果是做10CFU/ml的產(chǎn)品放行檢查,則需要抽提了。細胞基質(zhì)的驗證總是要做的。 問:做qPCR,一個陰性對照Ct約為40,也有擴增曲線。是什么原因? 答:Ct值大于40可能是由于產(chǎn)生非特異性信號(如primer artefacts)以及極微小的污染所致。 但是,該結(jié)果是不具有可重復(fù)性的,因此結(jié)果仍然是陰性。 問:一步法的盒子的靈敏度是否總低于經(jīng)典法試劑盒?有沒有可能一步法的盒子也能檢測10CFU? 答:廠家回復(fù)如下:意思是一步法的樣本量為2ul用于支原體篩查,經(jīng)典法為10ul,用于產(chǎn)品的放行檢測。檢測10CFU的標準品非常具有挑戰(zhàn)性。一步法因為樣本量不夠,很難達到10CFU/ml。如果客戶想要包含DNA聚合酶的PCR試劑盒,可以選擇VenorGeM Classic G型試劑盒。它和經(jīng)典法(不含酶)的交叉驗證確實做過,顯示同樣的靈敏度。但全套的驗證沒有做過。 問:支原體10cfu標準品是干粉吧? 配完后是多少體積? 答:是凍干粉,加基質(zhì)液后是1ML體積。 問:基質(zhì)液產(chǎn)品里帶嗎? 答:這個產(chǎn)品里不帶,是客戶自己要檢測哪類樣品,就用樣品里的基質(zhì)液(例如用的哪個培養(yǎng)基) 由于篇幅有限,以上就是支原體檢測常見問題答疑(二),我們下篇文章繼續(xù)分享。如果您還想了解更多的信息,可咨詢德國MB中國區(qū)總代理北京締一生物科技有限公司官網(wǎng):www.276mk.com。 |
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