我國科學家開發新型線粒體堿基編輯器，德國MB微生物控制試劑助力科研發展

基因研究相關的分子實驗室，對實驗環境的潔凈度有一定需求。嚴格控制環境中的DNA、RNA及相關酶的污染，有利于提高實驗的穩定性。

堿基編輯能夠準確地突變目標DNA序列，并有助于解剖基因和調控元件的功能，疾病建模，以及開發治療疾病的療法。核DNA中的堿基編輯是通過聚集規則間隔短回文重復序列(CRISPR)衍生的堿基編輯器來實現的。

遺憾的是，由于缺乏將引導RNA傳遞到線粒體的方法，CRISPR堿基編輯器目前不適用于mtDNA編輯。最近，轉錄激活物樣效應物(TALE)衍生的堿基編輯器DdCBEs和TALEDs已被開發用于催化mtDNA中的C-to-T和A-to-G編輯。

這些方法依賴于DddAtox，一種來自于cenocepacia伯克霍爾德菌(Ddd_Bc)的dsDNA脫氨酶。原來的Ddd_Bc需要嚴格的TC序列context。通過噬菌體輔助進化，Mok等人進一步獲得了一種Ddd_Bc變體，可以催化HC序列上下文中的C-to-T編輯。

締一生物的德國MB的PCR Clean，高效清除實驗環境中的無關分子污染。

此外，de Moraes等人還研究了其他的細菌脫氨酶毒素家族，并確定了具有不同序列背景和底物(例如，單鏈和雙鏈DNA)偏好的脫氨酶。但是，適合GC上下文目標的ddcbe仍然不可用。此外，在其他物種中是否能發現更多的dsDNA脫氨酶尚不清楚。

在近日的一項研究中，研究人員鑒定并設計了dsDNA脫氨酶同源物來解決上述問題。相關研究發表在《Nature Communications》上，文章標題為：“DddA homolog search and engineering expand mitochondrial base editing”。

通過PSI-BLAST和脫氨實驗，研究人員發現了一種來自siiaoa sunii (Ddd_Ss)的dsDNA脫氨酶，該酶具有高活性和廣泛的序列相容性。基于這種dsDNA脫氨酶，研究人員開發了高效的堿基編輯工具，在多個mtDNA位點上引入突變，包括以前無法訪問的GC環境中的疾病相關突變。

最后，通過引入Ddd_Ss到Ddd_Bc的單氨基酸取代，研究人員成功地提高了DdCBE_Bc的活性和序列相容性。

締一生物的德國MB的PCR Clean，高效清除實驗環境中的DNA、RNA污染。