lamp檢測(cè)技術(shù)的工作原理介紹

lamp檢測(cè)技術(shù)原理

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發(fā)表時(shí)間:2023-08-10 11:00

LAMP技術(shù)是環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增(Loop-Mediated Isothermal Amplification,LAMP)是一種分子生物學(xué)技術(shù),用于在等溫條件下快速擴(kuò)增DNA或RNA分子。與傳統(tǒng)的聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)相比,LAMP技術(shù)不需要復(fù)雜的溫度循環(huán),只需要恒定的溫度即可實(shí)現(xiàn)核酸的高效擴(kuò)增。LAMP主要分為以下幾個(gè)步驟:生產(chǎn)用于反應(yīng)的起始材料,循環(huán)擴(kuò)增和伴隨循環(huán)的延伸和再循環(huán)。

生產(chǎn)用于反應(yīng)的起始材料:

引物設(shè)計(jì):LAMP擴(kuò)增過(guò)程中使用了多個(gè)引物,包括兩對(duì)外部引物(F3和B3)以及兩對(duì)內(nèi)部引物(FIP和BIP),以及一個(gè)環(huán)引物(Loop primer)。這些引物的設(shè)計(jì)是基于目標(biāo)DNA或RNA的特定序列,以確保高度特異性的擴(kuò)增。

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循環(huán)擴(kuò)增:

生產(chǎn)啞鈴狀結(jié)構(gòu)的形成外部引物較短(21-24bp),并且在反應(yīng)混合物中的濃度較低,與模板結(jié)合的速度比內(nèi)部引物慢。向前和向后的內(nèi)部和外部引物與BstDNA聚合酶(在60-65°C下顯示出高鏈置換活性)相結(jié)合,形成啞鈴狀DNA結(jié)構(gòu)

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伴隨循環(huán)的延伸和再循環(huán)

隨后的階段涉及自引模板的指數(shù)擴(kuò)增和鏈的替換,從而產(chǎn)生雙鏈DNA的混合物。LAMP的最終輸出是花椰菜狀結(jié)構(gòu)。

與PCR不同,LAMP在單一溫度下(通常為60-65℃)進(jìn)行擴(kuò)增,因此不需要溫度循環(huán)。這有助于操作簡(jiǎn)單且耗時(shí)較短。

特殊結(jié)構(gòu)的引物:LAMP技術(shù)中的引物具有特殊的結(jié)構(gòu),其中FIP(Forward Inner Primer)由F1c和F2組成,BIP(Backward Inner Primer)由B1c和B2組成。這些引物的結(jié)構(gòu)促使在擴(kuò)增過(guò)程中產(chǎn)生大量的特定結(jié)構(gòu)的產(chǎn)物,從而進(jìn)一步提高擴(kuò)增效率。

自我啟動(dòng)的擴(kuò)增過(guò)程:LAMP技術(shù)通過(guò)自我啟動(dòng)的過(guò)程在目標(biāo)核酸序列上進(jìn)行擴(kuò)增。一旦引物與目標(biāo)序列的互補(bǔ)區(qū)域匹配,引物的結(jié)構(gòu)促使產(chǎn)物不斷生成,形成一個(gè)DNA“蘑菇云”狀的結(jié)構(gòu)。

環(huán)結(jié)構(gòu)的形成:LAMP擴(kuò)增的一個(gè)關(guān)鍵特征是環(huán)結(jié)構(gòu)的形成。在LAMP擴(kuò)增過(guò)程中,Loop引物在互補(bǔ)區(qū)域與目標(biāo)序列結(jié)合,促使產(chǎn)物的循環(huán)形成。這種環(huán)結(jié)構(gòu)不僅穩(wěn)定了產(chǎn)物,還使得新的引物不斷與目標(biāo)序列結(jié)合,從而實(shí)現(xiàn)高效擴(kuò)增。

產(chǎn)物分析:LAMP擴(kuò)增產(chǎn)物通常通過(guò)肉眼可見的方法進(jìn)行分析,例如使用熒光染料,pH指示劑或者裸眼觀察沉淀物等。產(chǎn)物的積累會(huì)導(dǎo)致可觀察的變化,從而確定擴(kuò)增是否成功。


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