N6-甲基腺苷修飾與環(huán)狀RNA之間的串?dāng)_:目前的理解和未來的方向 二維碼
發(fā)表時間:2022-11-11 10:56 n6 -甲基腺苷(m6A)是真核rna中普遍存在的一種內(nèi)部修飾,由所謂的writers、erasers和讀子readers調(diào)控。m6A已被證實在調(diào)節(jié)RNA成熟、定位、翻譯和代謝方面發(fā)揮關(guān)鍵的分子功能,從而在細(xì)胞、發(fā)育和疾病過程中發(fā)揮重要作用。環(huán)狀rna (Circular RNAs, circRNAs)是一類通過反向剪接產(chǎn)生的共價閉合單鏈結(jié)構(gòu)的非編碼rna。 circrna還通過獨特的機制參與生理和病理過程。盡管幾年前就發(fā)現(xiàn)了 m6A 和 circRNA,但由于近年來分子生物學(xué)技術(shù)的進(jìn)步,它們引起了越來越多的研究興趣。 最近,幾位學(xué)者研究了m6A和circRNA之間的串?dāng)_。本文綜述了m6A和circrna的研究現(xiàn)狀,并結(jié)合現(xiàn)有研究綜述了它們之間的串?dāng)_。這可對今后的研究方向提出了一些建議。 RNA修飾(例如,n6 -甲基腺苷[m6A], 5-甲基胞嘧啶,偽嘌呤,n4 -乙酰胞苷,核糖甲基化,和n1 -甲基鳥苷),最近已成為真核生物基因表達(dá)的重要轉(zhuǎn)錄后表觀遺傳調(diào)節(jié)劑。在這些RNA修飾中,m6A是迄今為止最常見和研究最充分的。m6A 是一種可逆修飾,可在幾乎所有類型的 RNA 分子的 N6 位置甲基化腺苷,包括 mRNA、小核 RNA、核糖體 RNA 和非編碼 RNA。m6A于20世紀(jì)70年代**被發(fā)現(xiàn),由于高通量m6A測序和甲基化RNA m6A免疫沉淀技術(shù)的進(jìn)步,在過去幾年中迅速發(fā)展。此外,m6A已被證實在調(diào)節(jié)RNA成熟、定位、翻譯和代謝方面發(fā)揮關(guān)鍵的分子功能。m6A動態(tài)存在并參與多種生理和病理過程,包括生長、發(fā)育、衰老和疾病。 環(huán)狀rna (circrna)是一類內(nèi)源性rna,具有共價閉合單鏈結(jié)構(gòu),也存在于真核生物中。大部分環(huán)狀rna為非編碼rna,部分胞質(zhì)環(huán)狀rna具有編碼潛能,可翻譯為多肽。這些分子也在幾年前被發(fā)現(xiàn),但最近由于高通量RNA測序和生物信息學(xué)的進(jìn)展引起了研究人員的關(guān)注。與其他類型的rna類似,circrna參與維持人體正常生理功能,以及各種人類疾病的發(fā)生和發(fā)展。與其他RNA分子不同,環(huán)狀RNA具有獨特的生物起源、生物學(xué)特性和特性。因此,它們可能表現(xiàn)出對RNA修飾的響應(yīng)特性。 近來,有學(xué)者將這兩個近期的熱門話題結(jié)合起來,研究它們之間的串?dāng)_。本文綜述了目前對m6A和環(huán)狀rna的認(rèn)識,并在現(xiàn)有研究基礎(chǔ)上總結(jié)了m6A修飾與環(huán)狀rna之間的串?dāng)_。此外,作者發(fā)現(xiàn)在這一領(lǐng)域仍有許多問題有待解決,并對未來的研究方向提出了一些建議。 m6A與環(huán)狀rna的串?dāng)_ 在這篇綜述中,作者描述了m6A修飾和環(huán)狀rna生物學(xué)的復(fù)雜性,并提出了它們之間的識別串?dāng)_。雖然在這一領(lǐng)域已經(jīng)有了一些研究,但m6A與circrna之間的相關(guān)性研究仍處于起步階段。 首先,之前的研究僅報道側(cè)翼內(nèi)含子反向互補序列中的 m6A 通過內(nèi)含子配對驅(qū)動的環(huán)化模式促進(jìn) circRNA 的產(chǎn)生。然而,其他研究證實pre-mRNA的m6A修飾可能調(diào)節(jié)rna -蛋白的相互作用和pre-mRNA的加工。 第二,雖然已經(jīng)證實m6A可以調(diào)節(jié)circrna的穩(wěn)定性,但考慮到circrna的特定環(huán)狀結(jié)構(gòu)和降解途徑,在m6A調(diào)節(jié)穩(wěn)定性的機制上,circrna與線性rna是否存在差異? 第三,雖然m6A是circrna翻譯的重要啟動因子,但它們是翻譯維持因子還是終止因子尚不清楚。第四,circRNAs 可以對抗 m6A writers 的修飾,這也可能適用于erasers和readers。所以m6A與circrna之間的相關(guān)性仍需進(jìn)一步研究。 |
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