N6-甲基腺苷修飾與環狀RNA之間的串擾:目前的理解和未來的方向 二維碼
發表時間:2022-11-11 10:56 n6 -甲基腺苷(m6A)是真核rna中普遍存在的一種內部修飾,由所謂的writers、erasers和讀子readers調控。m6A已被證實在調節RNA成熟、定位、翻譯和代謝方面發揮關鍵的分子功能,從而在細胞、發育和疾病過程中發揮重要作用。環狀rna (Circular RNAs, circRNAs)是一類通過反向剪接產生的共價閉合單鏈結構的非編碼rna。 circrna還通過獨特的機制參與生理和病理過程。盡管幾年前就發現了 m6A 和 circRNA,但由于近年來分子生物學技術的進步,它們引起了越來越多的研究興趣。 最近,幾位學者研究了m6A和circRNA之間的串擾。本文綜述了m6A和circrna的研究現狀,并結合現有研究綜述了它們之間的串擾。這可對今后的研究方向提出了一些建議。 RNA修飾(例如,n6 -甲基腺苷[m6A], 5-甲基胞嘧啶,偽嘌呤,n4 -乙酰胞苷,核糖甲基化,和n1 -甲基鳥苷),最近已成為真核生物基因表達的重要轉錄后表觀遺傳調節劑。在這些RNA修飾中,m6A是迄今為止最常見和研究最充分的。m6A 是一種可逆修飾,可在幾乎所有類型的 RNA 分子的 N6 位置甲基化腺苷,包括 mRNA、小核 RNA、核糖體 RNA 和非編碼 RNA。m6A于20世紀70年代**被發現,由于高通量m6A測序和甲基化RNA m6A免疫沉淀技術的進步,在過去幾年中迅速發展。此外,m6A已被證實在調節RNA成熟、定位、翻譯和代謝方面發揮關鍵的分子功能。m6A動態存在并參與多種生理和病理過程,包括生長、發育、衰老和疾病。 環狀rna (circrna)是一類內源性rna,具有共價閉合單鏈結構,也存在于真核生物中。大部分環狀rna為非編碼rna,部分胞質環狀rna具有編碼潛能,可翻譯為多肽。這些分子也在幾年前被發現,但最近由于高通量RNA測序和生物信息學的進展引起了研究人員的關注。與其他類型的rna類似,circrna參與維持人體正常生理功能,以及各種人類疾病的發生和發展。與其他RNA分子不同,環狀RNA具有獨特的生物起源、生物學特性和特性。因此,它們可能表現出對RNA修飾的響應特性。 近來,有學者將這兩個近期的熱門話題結合起來,研究它們之間的串擾。本文綜述了目前對m6A和環狀rna的認識,并在現有研究基礎上總結了m6A修飾與環狀rna之間的串擾。此外,作者發現在這一領域仍有許多問題有待解決,并對未來的研究方向提出了一些建議。 m6A與環狀rna的串擾 在這篇綜述中,作者描述了m6A修飾和環狀rna生物學的復雜性,并提出了它們之間的識別串擾。雖然在這一領域已經有了一些研究,但m6A與circrna之間的相關性研究仍處于起步階段。 首先,之前的研究僅報道側翼內含子反向互補序列中的 m6A 通過內含子配對驅動的環化模式促進 circRNA 的產生。然而,其他研究證實pre-mRNA的m6A修飾可能調節rna -蛋白的相互作用和pre-mRNA的加工。 第二,雖然已經證實m6A可以調節circrna的穩定性,但考慮到circrna的特定環狀結構和降解途徑,在m6A調節穩定性的機制上,circrna與線性rna是否存在差異? 第三,雖然m6A是circrna翻譯的重要啟動因子,但它們是翻譯維持因子還是終止因子尚不清楚。第四,circRNAs 可以對抗 m6A writers 的修飾,這也可能適用于erasers和readers。所以m6A與circrna之間的相關性仍需進一步研究。 |
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