野生藍莓端粒-端粒無間隙參考基因組

藍莓是一種常見的草莓屬植物，果實較小，以口感鮮美、酸甜平衡、營養(yǎng)豐富而聞名。它富含各種維生素和抗氧化劑。然而，栽培藍莓遺傳資源有限，嚴重阻礙了藍莓的開發(fā)利用。因此，利用野生藍莓的遺傳資源進行育種，對提高栽培品種的抗逆性和品質(zhì)至關重要。

藍莓(Vaccinium duclouxii)原產(chǎn)于中國西南地區(qū)，是一種具有較高營養(yǎng)、藥用和觀賞價值的特有野生藍莓品種。具有較強的抗逆性和環(huán)境適應性。然而，缺乏高質(zhì)量的基因組嚴重制約了其應用和發(fā)展。

2023年10月，《園藝研究》發(fā)表了一篇題為“野生藍莓(Vaccinium duclouxii)的端粒到端粒無間隙參考基因組提供了高可溶性糖和花青素積累”的觀點。

本研究采用PacBio HiFi、ONT超長和Hi-C測序數(shù)據(jù)對duclouxii弧菌基因組進行端粒到端粒(T2T)從頭組裝。組裝的基因組大小為573.67 Mb，成功捕獲了全部12條無間隙染色體，共注釋了41953個基因。重復序列占54.84%，獲得了最完整和高質(zhì)量的Vaccinium屬基因組。通過轉(zhuǎn)錄組學和代謝組學的綜合分析，揭示了杜氏葡萄成熟過程中糖、酸積累和花青素生物合成的分子機制。該研究為了解藍莓屬植物的進化奠定了基礎，并為藍莓的遺傳改良和育種工作提供了有價值的見解。

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