揭示真菌感染的新見解

全球真菌感染每年影響10億人，造成150萬人死亡，由于越來越多的醫(yī)療手段加劇了易感性，真菌感染人數(shù)正在上升。器官移植后接受化療或免疫抑制治療的患者往往出現(xiàn)免疫系統(tǒng)受損。鑒于耐藥菌株的出現(xiàn)，目前抗真菌藥物的種類有限，以及它們的成本和副作用，這些感染的治療具有挑戰(zhàn)性，迫切需要更有效的治療方法。

在這種情況下，由ICREA研究員Toni Gabaldón博士領(lǐng)導(dǎo)的來自生物醫(yī)學(xué)研究所(IRB Barcelona)和巴塞羅那超級計算中心-國家中心Supercomputación (BSC-CNS)的研究小組已經(jīng)確定了六種真菌病原體念珠菌中數(shù)百個基因受到近期臨床相關(guān)選擇的影響。

“這項工作強(qiáng)調(diào)了這些病原體如何適應(yīng)人類和抗真菌藥物，并提供了有價值的知識，可以更好地治療念珠菌感染，”巴塞羅那IRB和BSC比較基因組學(xué)實驗室負(fù)責(zé)人Gabaldón博士解釋說。

來自6個不同物種的2000多個基因組

該研究通過分析來自6種主要念珠菌臨床樣本的約2000個基因組，深入研究了念珠菌病原體的進(jìn)化景觀。這些基因組存儲在公共數(shù)據(jù)庫中。研究人員將這些基因組與參考基因組進(jìn)行了比較，創(chuàng)建了一個全面的遺傳變異目錄。

在先前研究耐藥菌株工作的基礎(chǔ)上，這組科學(xué)家進(jìn)行了一項全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)，以確定臨床分離株中與抗真菌藥物耐藥性相關(guān)的遺傳變異。該方法提供了對三種念珠菌對七種抗真菌藥物的已知和新的耐藥機(jī)制的見解。“此外，該研究還發(fā)現(xiàn)了一個令人擔(dān)憂的發(fā)現(xiàn):通過易感菌株和耐藥菌株之間的交配，耐藥性可能會傳播，從而導(dǎo)致耐藥念珠菌病原體的流行，”同一實驗室的博士后研究員、該研究的**作者Miquel àngel Schikora-Tamarit博士解釋說。

此外，通過關(guān)注最近在臨床菌株中獲得的變異，研究人員發(fā)現(xiàn)了最近選擇的共享和物種特異性遺傳特征，這些特征告知了哪些適應(yīng)可能需要在與人類相關(guān)的環(huán)境中茁壯成長和傳播。

除了對念珠菌適應(yīng)性的新見解之外，該研究還提供了一個有價值的資源，即變種、選擇特征和耐藥性驅(qū)動因素的綜合目錄。這些知識不僅有助于我們對這些感染的理解，而且為未來的實驗和開發(fā)更有效的治療念珠菌感染的潛在進(jìn)展奠定了基礎(chǔ)。

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