qPCR技術絕對定量與相對定量的區別

qPCR技術絕對定量vs相對定量

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發表時間:2024-10-23 15:43

qPCR技術(實時熒光定量PCR)中的絕對定量與相對定量是兩種不同的定量方法,它們之間存在明顯的區別。以下是對這兩種定量方法的詳細比較:

一、定義與原理

絕對定量

定義:測定待測樣本中目的基因的準確拷貝數。

原理:用已知拷貝數的標準品繪制標準曲線,將待測樣本目的基因的Ct值(循環閾值,即熒光信號強度達到預設閾值時所經歷的擴增循環數)帶入標準曲線中,進而獲得樣本中目的基因的準確拷貝數。

相對定量

定義:通過內參基因表征不同樣本中目的基因的倍數關系,不需要測定樣本中目的基因的準確拷貝數。

原理:選擇穩定的內參基因作為參照,通過比較實驗樣本與對照樣本中靶基因的Ct值差異,得出實驗樣本中靶基因相對于對照樣本的表達量變化倍數。

二、操作步驟

絕對定量

準備已知濃度的標準品,并確保標準品與待測樣本中的目的基因具有相同的擴增效率。

將標準品稀釋成不同濃度,作為模板進行PCR反應。

以標準品拷貝數的對數值為橫坐標,以測得的Ct值為縱坐標繪制標準曲線。

對待測樣本進行PCR反應,測定其Ct值,并根據標準曲線計算待測樣本中目的基因的拷貝數。

相對定量

選擇合適的內參基因,并確保內參基因在實驗條件下的表達穩定。

對實驗樣本和對照樣本進行PCR反應,分別測定靶基因和內參基因的Ct值。

根據內參基因的Ct值對靶基因的Ct值進行均一化處理,以消除樣本間的差異。

計算實驗樣本中靶基因相對于對照樣本的表達量變化倍數。

三、應用與特點

絕對定量

應用:常用于食品藥品病原體檢測、轉基因食品檢測等需要準確測定目的基因拷貝數的場合。

特點:能夠獲得待測樣本中目的基因的準確拷貝數,后續數據處理方法簡單,但成本較高,每個基因都需購買對應的標準品。

相對定量

應用:多用于科研領域的基因表達量變化分析,如研究藥物對基因表達的影響等。

特點:不能獲取樣本中目的基因的準確拷貝數,但可以比較不同樣本中基因表達量的倍數關系。成本較低,但后續數據處理較繁瑣。

四、注意事項

絕對定量

標準品的選擇和品質至關重要,應確保標準品與目的基因有相同的擴增效率,且標準品需拷貝數(濃度)精準、純度高。

標準曲線的繪制應滿足一定的質量要求,如R2值應大于0.995等。

相對定量

內參基因的選擇至關重要,需綜合考慮物種、處理條件、樣本組織來源等因素進行內參基因選擇。

應確保實驗樣本與對照樣本的靶基因從等量原料中得到,并盡量消除操作誤差等因素對實驗結果的影響。

綜上所述,qPCR技術中的絕對定量與相對定量在定義、原理、操作步驟、應用與特點以及注意事項等方面都存在明顯的區別。在選擇使用哪種定量方法時,應根據具體的實驗需求和樣本特點進行綜合考慮。

文章分類: 科學文章
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